7×24小时 服务热线:0531-86965675  承森微信: ·

Hieff NGS™ MaxUP II DNA Library Prep Kit

新品推荐:Hieff NGS™ MaxUP II DNA Library Prep Kit 添加时间:2018-3-4 23:39:29

DNA 文库构建是NGS样本制备的核心环节。文库质量直接影响测序数据质量——如mapping rate、coverage、complexity、bias等。要想获得好的文库,必须选择好的建库试剂盒,而建库试剂盒的关键,在于其文库转化率,即DNA片段双端接头连接效率,因为只有双端连接成功的DNA,才能够被有效扩增最终成为测序模板。

产品特点

Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina®,采用高质量的酶学组成,改进型接头连接技术,以及具有强扩增效率的高保真酶,显著提高文库转化率与扩增效率,助理完成更好。

 适用500 pg-1 μg所有DNA样本

 业界领先文库转化率,高达60%

 产品优异性能已在基因组、FFPE、cfDNA等多种样本中验证

 2.5小时内收获优异文库 ,PCR或PCR-free方式均可

 全程控制原料、人员、工艺与质量,全力保障批次性能与稳定性
 

1. 文库转化效率高达60%

文库转化率,即DNA片段双端接头连接效率。只有双端连接成功的DNA,才能够被有效扩增最终成为测序模板。

图1  Agilent  2100 检测350bp平末端DNA片段单端和双端连接产物峰。

0:350bpDNA片段峰、1:单端接头连接产物峰、2:双端接头连接产物峰。测试基于各公司的标准 protocol进行。

图2  接头连接效率百分比(%)。

对图1峰面积进行积分后的定量结果显示Hieff NGS™ MaxUp II Kit 的双端连接效率可达60%。

2. 不同GC样本,扩增效率测试

Hieff NGS™ MaxUp II Kit中使用具有强扩增效率的Super CanaceTM High-Fidelity Mix用于文库扩增。以1 ng GC含量分别为38%、50%、70%的400 bp DNA片段为起始样本,12 cycles扩增,Qubit检测不同试剂盒所得产物浓度,Super Canace表现极佳。

表1  扩增模块效率比较。

产品名称

GC 38% (ng)

GC 50% (ng)

GC 70% (ng)

Super CanaceTM High-Fidelity Mix

25.6

18

17.1

K*-HiFi mix

15.8

16.7

21.1

3. FFPEcfDNA样本, 文库产量测试

Hieff NGS™ MaxUp II Kit以FFPE和cfDNA为起始样本建库,相对同类型试剂盒品牌 K*,在相同扩增循环数下,获得更多文库产量。

表2  FFPE、cfDNA样本文库产量比较。

样本

100 ng FFPE

5 ng cfDNA

7 cycles (ng)

10 cycles (ng)

9 cycles (ng)

12 cycles (ng)

MaxUP II

400

2000

120

1200

K* 品牌

150

1100

100

1080

注:FFPE样本来自小鼠肺蜡块,固定时间6个月;cfDNA样本来源于血浆。

4. 无偏好性的测序质量

在不同GC含量样本中,使用Hieff NGS™ MaxUP II Kit均能获得碱基质量好且覆盖度均一的测序数据。

表3  不同GC样本测序数据。

样本

Mapped Reads (%)

Coverage (%)

Average

5×

10×

15×

20×

蜡状芽孢杆菌(GC 34%)

93.8

99.644

99.643

99.641

99.639

99.638

大肠杆菌(GC 51%)

92.7

93.057

92.782

92.687

92.625

92.579

嗜盐杆菌(GC 65%)

94.2

99.598

99.028

98.391

97.885

97.419

 

  

图3  不同GC含量样本测序偏好性图谱。

5. 2.5小时内高效

表现如此优秀,使用起来也非常方便哦!